Die Villa del Balbianello wurde Ende des 18. Jahrhunderts von Kardinal Angelo Maria Durini an der Stelle eines alten Franziskanerklosters erbaut.
Im 19. Jahrhundert, nach dem Tod des Kardinals, ging die Villa in den Besitz seines Enkels Graf Luigi Porro Lambertenghi über. Danach wurde die Villa Balbianello vom Marquis Giuseppe Arconati Visconti erworben, der einige große Intellektuelle zu Gast hatte, wie Alessandro Manzoni, Giovanni Berchet und Giuseppe Giusti.
Gianmartino Arconati Visconti, Giuseppes Sohn, nahm einige Verbesserungen an den Gärten und der Loggia der Villa vor, aber der Niedergang der Adelsfamilie führte schließlich zu einem Zustand der Verwahrlosung.
Im Jahr 1919 wurde die Villa del Balbianello von Butler Ames, einem amerikanischen Soldaten und Geschäftsmann, erworben, der die Villa in ihrem ursprünglichen Glanz restaurierte.
Seine Erben übergaben die Villa 1974 an den berühmten Unternehmer und Entdecker Guido Monzino. Er verschönerte die Villa mit einer reichen Sammlung von Artefakten, die er während seiner Expeditionen erwarb.
1988 starb Monzino kinderlos und schenkte die Villa del Balbianello der FAI (Fondo per l’Ambiente Italiano).